朝霞照映的海面上,漂浮着一艘装载着炸弹的谜一般的船只,这艘船就是一切的开始。京都的舞鹤港口,日本海上自卫队正在举行难得的搭乘宙斯盾驱逐舰体验航海活动。柯南、小兰、毛利小五郎和少年侦探团等人当选,与全国各地聚集来的孩子们一起登…